El órgano jurisdiccional impugnó mediante la controversia 53/2015 el decreto 2758 por el que se reformaron, adicionaron y derogaron diversas disposiciones de la Constitución Política del Estado Libre y Soberano de Morelos.
El magistrado presidente del TEE, Hertino Avilés Albavera, resaltó que está a favor de la transparencia y el combate a la corrupción, pero la reforma del Congreso estatal (aprobada por la anterior legislatura) puede tener efectos negativos sobre el órgano jurisdiccional al violar su independencia y autonomía.
Explicó que con la reforma electoral federal del 2014 es facultad del Senado de la república el nombramiento de los magistrados electorales de los tribunales electorales, cuyos órganos fueron dotados de autonomía e independencia para evitar justamente presiones e influencias de los poderes locales.
Indicó que la reforma a la constitución local prevé facultades de suspensión y fincamiento de responsabilidades a los titulares de las instituciones, y que por tratarse una norma auto-aplicativa puede causar con posteridad agravios al órgano jurisdiccional.
Consideró que toca al Senado de la república fijar los lineamientos de fiscalización y control interno de los tribunales electorales locales, sin embargo, a través de la controversia constitucional espera que sea la Suprema Corte de Justicia de la Nación quien se pronuncie si la reforma local en materia de transparencia y combate a la corrupción podría o no causar agravio a la autonomía e independencia de la Tribunal Estatal Electoral.
La Comisión de Derechos Humanos del Estado de Morelos (CDHEM) y el Instituto Morelense de Procesos Electorales y Participación Ciudadana (Impepac) también promovieron sendas controversias constitucionales para combatir la reforma en materia de transparencia y combate a la corrupción por considerar también que se violenta su autonomía.